大肠杆菌是一个革兰氏阴性细菌，如果是致病性的大肠杆菌感染，需要选择抗生素进行治疗。抗生素选择的原则是如果能做细菌培养和药物敏感试验，尽量做细菌培养和药物敏感试验，根据药物敏感试验的结果，选择敏感性好，同时物美价廉的抗生素进行治疗。
如果没有条件做药物敏感试验和细菌培养，可以根据经验进行用药。可以针对革兰氏阴性菌有效的药物。根据致病性大肠杆菌感染的部位不同，选择抗生素。
如果是肠道致病性大肠杆菌感染，即患有肠炎，此时可以选择氨基糖甙类抗生素，如庆大霉素，喹诺酮类抗生素，如氟哌酸、左氧氟沙星类，还可以选择广谱的抗生素，如头孢类抗生素，还要根据大肠杆菌感染的严重程度选择抗生素，如果是普通感染，可能只需使用几支庆大霉素就可以解决问题。
如果是严重的感染，如肺部致病性大肠杆菌感染，此时口服药的效果较差，患者需要静脉用药，甚至要用头孢类抗生素，或者是用二代头孢、三代头孢类药物，需要根据患者的病情，进行决定。
大肠杆菌用什么抗生素
大肠杆菌主要寄生在大肠内，除部分菌型能引起腹泻外，一般不致病。但若大肠杆菌侵袭其他部位时可能会导致感染，可用头孢类、碳青霉烯类、氨基糖苷类、喹诺酮类等抗生素治疗。
1、头孢类抗生素：大部分三、四代头孢菌素均对大肠杆菌具有抑制、消灭的作用，三代头孢如注射用头孢噻肟钠、注射用头孢曲松钠、注射用头孢他啶等。而四代头孢价格较为昂贵，但效果远优于三代头孢，主要包括注射用硫酸头孢匹罗、注射用盐酸头孢吡肟等药物;
2、碳青霉烯类抗生素：如注射用亚胺培南西司他丁钠等药物，抗菌谱较广，对革兰阳性和阴性菌、多重耐药菌、铜绿假单胞菌等均存在较强抑菌特异性，抗菌范围包括大肠杆菌、链球菌、金黄色葡萄球菌等，因此也可以用于治疗大肠杆菌;
3、氨基糖苷类抗生素：注射用硫酸链霉素、硫酸卡那霉素注射液等药物，可以用于治疗革兰氏阴性杆菌，如大肠杆菌等导致的感染性疾病;
4、喹诺酮类抗生素：盐酸环丙沙星片、盐酸左氧氟沙星片等，可以用于大肠杆菌导致的胃肠道感染，还可以用于治疗呼吸系统、泌尿系统、皮肤等感染。
